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同学你好：
这里不能互换的。

식사하지 않으셨으니까 是 식사하다 + 지 않다 + 시 + 었 + 으니까 构成的，
지 않다 是表示否定的语法，
시 是敬语词尾，表示主语尊敬的，这里主语是爷爷，所以是需要加敬语词尾的。

었  是过去时制词尾，表示过去时态的，
韩语中 아직+否定，表示还没...含义时，是习惯搭配过去时态使用的，
例如：아직 안 먹었어요. 还没吃呢。
在连接时，시었 缩略成 셨 形式了。

同学想要换成的句子，식사하지 않으니까
这里缺少敬语词尾 시 来表示对爷爷的尊敬，
然后没有加过去时态，不太符合韩语表达习惯。
祝学习愉快~