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同学好，

这里的with a message是 with的介词用法，表伴随状态，翻译为： 带着…/ 和…
例如：The teacher came in the classroom with a book in his hand.
        老师手上拿着本书进来教室了。
        I will go to the zoo with my parents next weekend.
        我下周末将和爸妈一起去动物园。

故此处 a message就是with这个介词后的宾语哦~ 整个表示一种伴随着的状态。 后面的that引导了一个同位语从句，解释message的内容。

故整句话翻译为：我从林先生那里过来,他让我告诉你他下午不能见你了.

希望以上能帮助到同学~如果还有其他问题，欢迎同学继续在答疑区提问，祝同学在沪江学习愉快！