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同学你好。
집이 어디에 있습니까? 家在哪里？
使用主格助词이，相对强调主语家。
나오코 씨 집은  어디입니까? 直子的家是哪里？
使用添意助词은，相对强调谓语部分是哪里？

1. -이/가为用于体词后面的主格助词，表示主语。
形态：体词有收音接이，体词无收音接가。比如：
여기가 회사입니다. 这里是公司。
이것이 사전입니다. 这是词典。

2. -은/는为用于体词后面的助词，表示句子所陈述的主体或要讨论的话题。
形态：体词有收音时接은，无收音时接는。比如：
북경은 중국의 수도입니다. 北京是中国的首都。

这两组助词相比之下，区别如下：
① 对首次出现的对象或新话题进行叙述时要用-이/가；
而该对象或主题再次出现并重新叙述时(说话者和听话者都已知道)则要用-은/는来表达：
比如：어제 철수가 전화 왔다. 철수는 내년에 유학을 간다고 했다. 昨天哲洙来电话了，哲洙说明年去留学。

② 当叙述一般性常识、属性及特征 ,下定义 , 提出普遍真理，解释命题等情况时, 句子的主题一般都用-은/는表示，在句中做主语。比如：
해는 동쪽에서 뜬다. 太阳从东边升起。
지구는 동글다. 地球是圆的。

③ 在双重主语（包孕句）句中，一般以大主语-은/는, 小主语-이/가的形式出现。
不过如果-이/가在句子中出现两次，则前面的-이/가表示整个句子的大主语并含有特指或强调的意味。而后面的-이/가则是谓语部分的小主语，比前面的-이/가范围要小。比如：
김치찌개는 맛이 있어요. 泡菜汤有味道。（김치찌개-大主语, 맛-谓语部分小主语）
철수가 키가 큽니다. 哲洙个子高。（철수-大主语(强调) 키-谓语部分小主语）
另外关于이/가和은/는的区别可以看下这里：http://kr.hujiang.com/new/p161772/
同学可以结合再梳理一下，祝同学学习愉快。