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同学你好~

空が飛ぶ，是错误的，“が”是提示动作的主语，就变成了“天空”在飞了……
空に飛ぶ，这个表述也不存在的，不太地道。

日语中表示移动性的自动词，前面接助词“を”表示移动的起点或经过的地点。常用的一些移动性自动词有：
「出る」「離れる」「去る」「卒業する」「出発する」「歩く」「登る」「渡る」「通る」「流れる」「走る」「散歩する」「横切る」「曲がる」「渡る」「泳ぐ」「飛ぶ」等。用「N+を+V (自动词)」的结构。
例如：
私が小学校を出たとき、父が死んだ。
故郷を離れる前の夜に、父といろいろ話しました。 　
交差点を渡ります。
公園を散歩します。
2012年に大学を卒業した。
廊下を走らないでください。
鳥が空を飛んでいます。
（同学看到这样表示移动性的自动词可以着重记忆一下）

虽然这里用“で”表示动作的地点也不算错误，但是日本人在这些词前面习惯用“を”，来表现一种在天空中来回穿梭的意味。更加地道一些哦~

希望以上解答可以帮到同学，若对助助的回复有疑问，请同学在【追问】框中提出哦。
祝同学学习愉快哦~｡◕‿◕｡