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同学你好~
in the morning通常泛指所有的早晨，所以多跟一般现在时连用，表示一般的、习惯的行为。
因此可以说What does she do in the morning?
What time do you usually wake up in the morning?
通常你早晨几点钟醒？

this morning指的是“今天早晨”这样一个具体的时间，因此可以与现在进行时连用。
What is she doing this morning? 可以的。
She's feeling no better this morning. 她今天早晨还是不见好。

祝同学学习进步~