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同学好：
she heard planes passing overhead 里面是hear sb./sth. doing 的结构，“听见某人/某物正在做什么”。
how 引导的是宾语从句，做谓语wondered 的宾语。
early next morning 是时间状语；
she 是主语；heard 是谓语，planes 是它的宾语，passing overhead 是宾语补足语；
and 连接了另一个“谓语+宾语”：wondered 是谓语【和heard 是并列谓语】，how she could send a signal 是它的宾语【因为是句子，所以是宾语从句】。

祝学习愉快～