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同学你好~
后一句是错误的，因为有两个谓语is和are，而一个句子应该只有一个谓语。
可以说What's your nationality? 或者 What nationality are you?

这两句话意思是一样的，只是语法结构不一样。
What nationality are you? 换成陈述语气 You are what nationality
主语是you,谓语是are，what nationality是表语  你是什么国籍

What is your nationality? 换成陈述语气 your nationality is what
主语是your nationality，谓语is, what 表语  你的国籍是什么

祝同学学习进步~