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同学你好～

不是的。
Mary said she already had had supper.  间接引语 （(第一个had是助动词have的过去分词，是过去完成时的一部分，第二个had是实义动词have的过去分词，表示“吃”，have supper吃晚饭）
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                  互相转换
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Mary said, I already had supper.         直接引语
或者：Mary said, I have already had supper.


下面详细解释一下：

间接引语是将直接引语变为由that引导的宾语从句跟在引述动词之后(that也可省略)：

“I don’t love her.” he says. 他说：“我不爱她。”
→He says that he doesn’t love her. 他说他不爱她。

直接引语变为间接引语时，若主句为过去时态，变为间接引语的宾语从句通常要将时态往后推一个，即。如：一般现在时变为一般过去时，一般将来时变为过去将来时，现在进行时变为过去进行时，现在完成时变为过去完成时，一般过去时也变为过去完成时，等等(若直接引语为过去完成时，变为间接引语可以不变)。
间接引语变为直接引语则相反，是往前推一个时态。
如：“I want to stay here.” he said. 他说：“我想留在这儿。”
→He said that he wanted to stay there. 他说他想留在那儿。
She said, “It’s raining very hard.” 她说：“雨下得很大。”
→He said that it was raining very hard.  她说雨下得很大。

所以这个问题里面，间接引语的主句时态是Mary said，一般过去时，直接引语的主句也应该是一般过去时，Mary said；间接引语的从句是she already had had supper是过去完成时，往前推一个时态，就是现在完成时，或者用一般过去式，所以就是I have already had supper. 或者I already had supper.

希望可以帮到你～祝你学习进步～