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Shrugging my shoulders, I began to walk away when, a moment later, he ran after me and thrust the pen into my hands.
我耸耸肩膀掉头走开了。一会儿，他突然从后追了上来，把笔塞到我手里。

句子结构分析:
shrugging my shoulders为现在分词短语，作方式状语，表示“以耸肩膀的方式”走开。
When引导时间状语从句，交代“我”走开时发生的事情。a moment later 这里作插入语。
插入语就是指插在句子中间，对句子起补充或附加的说明的成分，一般两边用逗号隔开。
插入语通常与句中其它成分没有语法上的关系，若将其去掉，句子结构仍然完整。插入语在句中主要起解释、说明、总结等作用。
所以这句话把插入语去掉，就是Shrugging my shoulders, I began to walk away when he ran after me and thrust the pen into my hands. 就是一个简单的when引导的时间状语从句啦～

希望可以帮到你～祝你学习进步～