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同学好：
he had had for so many years是定语从句，修饰the dream；
因为the dream 在定语从句里做宾语，引导定语从句的关系代词that/which省略掉了。
还原一下从句就是：he had had the dream for so many years；
这个句子是过去完成时，过去完成时的结构是：主语+had+过去分词；
因此，句子里第一个had 是时态里必须有的助动词；第二个had 是实义动词have“拥有”的过去分词形式。

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