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同学你好，

which has flourished for many years从语法结构上看是非限制性定语从句，对wildlife in Mexico起补充说明的作用，但并不影响句子的结构。所以这句话的主句是Wildlife in Mexico is now under attack by the industrialization of natural habitats. 而which has flourished for many years放在句子中间，将主句分隔开来，所以前后都要逗号。

希望有所帮助~