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同学好，
这里只能用“Yes, there are some on the bookcase.”来回答，而不用ones。
一般来说，表示指代时，ones前面会带有一个限定或修饰词，不会单独出现。比如：
- These or those? 这些还是那些？
- The green ones. 绿色的那种。
some做代词时可以不需要限制或修饰成分，单独做句子成分。比如：
When the chicken is cooked I'll freeze some.
鸡肉做熟后我会冷冻一些。
所以这里只能用some不用ones。

祝学习愉快~